6、维生素
有些微生物细胞内还含有数量不等、种类不同的维生素，如阿舒假囊酵母和棉阿舒囊霉细胞内含有较多的核黄素；丙酸杆菌属和放线菌菌丝体中含有较多的维生素B12。
7、抗生素
在目前研制和生产的8000多种抗生素中，约有70%是由微生物产生的，而其中又以放线菌最为突出。
8、无机盐类
无机元素约占细胞干重的10%，包括磷、硫、镁、铁、钾和钠等。一般以磷的含量为最高，约占全部灰分的40%。但在硫细菌中含有较高量的硫，铁细菌中含铁丰富。这些无机元素在细胞中除少数以游离状态存在外，大部分都以无机盐形式存在或结合于有机物质中。
除上述一些主要物质外，有些微生物细胞中还含有色素、毒素等。
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