2、自身免疫病
在异常情况下，机体对自身抗原发生免疫反应，导致机体受到损害，产生自身免疫病。自身免疫病的范围很广，如某些男性不育、甲状腺炎、全身性红斑狼疮等。遗传等因素对自身免疫疾病的发生有着重要的影响。
3、免疫缺陷
机体的免疫系统发育异常，会出现免疫缺陷，因而产生相应的严重疾病，难以治疗，直接威胁机体的生命。原发性免疫缺陷多系遗传基因缺陷所致，在免疫系统中的任何部位都可能发生，如缺乏B细胞和T细胞者，若不及时进行相应的骨髓移植，则很快死亡。继发性免疫缺陷是由病原微生物感染所引起 。继发性免疫缺陷表现为免疫功能低下，无法战胜侵入机体的外来抗原，如人类获得性免疫缺陷综合征（AIDS），即艾滋病就是 由于感染人类免疫缺陷病毒（HIV）引起的。艾滋病是近年来发现的一种新型传染病，死亡率很高。正常人感染上HIV，他的免疫系统中的重要成分会遭到严重破坏， 细胞、 细胞的免疫功能大为下降，很快发生各种机会性感染和恶性病变，最终死亡。
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