古生菌又可叫做古细菌或古菌，这一生物类群在进化途径上很早就与真细菌和真核生物相互独立。古生菌是一类非常特殊的细菌，大多生活在比较独特的生态环境中，比如产甲烷菌和多数嗜极菌（极端嗜热菌、极端嗜盐菌和Thermoplasma等）。
除Thermoplasma没有细胞壁之外，其余古生菌都有细胞壁。
就功能而言，古生菌的细胞壁与真细菌的细胞壁大都相似；就化学成分而言，古生菌的细胞壁与真细菌的细胞壁相差很大。在对古生菌的研究中发现，其细胞壁成分为假肽聚糖、糖蛋白，不存在真正的肽聚糖。对此，我们以甲烷杆菌属的假肽聚糖为例加以说明：
假肽聚糖，其结构虽然与肽聚糖相似，但其多糖骨架是N-乙酰葡糖胺和N-乙酰塔罗糖胺糖醛酸通过β-1,3-糖苷键交替链接而成，连接在后面氨基糖上的肽尾是由L-Glu、L-Ala、L-Lys三个L型的氨基酸组成，肽桥由L-Glu一个氨基酸组成。
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