细胞质是被细胞膜包围的除核区外的所有半透明、胶体状、颗粒状物质的总称。细胞质的含水量约是80%，主要成分是核糖体、贮藏物、多种的酶类、中间代谢物、质粒、各种营养物质和大分子的单体等，而少部分的细菌还含有类囊体、羧酶体、气泡或伴孢晶体等。
细胞质包括基质、细胞器和内含物。
基质是细胞质的基本成分，是在细胞质内呈现液态的部分，主要含有多种可溶性酶、糖、无机盐、水等；
细胞器在细胞的生理活动中起着重要的作用，主要包括线粒体、叶绿体、质体、内质网、高尔基体、溶酶体、中心粒以及周围物质等；
内含物是细胞质内的较大的颗粒状构造，主要包括贮藏物、磁小体、羧酶体、气泡等。
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