液体培养就是将微生物接种到液体培养基中进行培养。由于大多数发酵微生物是好氧性的，而且微生物只能利用溶解氧，所以如何保证培养液中有较高的溶解氧浓度至关重要。在实验室进行好氧菌液体培养的方法主要有四类：
1.试管液体培养 此法的通气效果一般较差，仅适用于培养兼性厌氧菌，以及进行微生物的各种生理生化试验。
2.浅层液体培养 在三角烧瓶中装入浅层培养液，且通气量与装液量、棉塞通气程度密切相关。通气量对微生物的生长速度和生长量有很大关系，该方法一般仅适于兼性厌氧菌。
3.摇瓶培养 将装有液体培养基的三角瓶（摇瓶），上盖8~12层纱布或用输送的棉塞塞住以阻止空气中杂菌或杂质进入瓶内，而空气可以透过棉塞供微生物呼吸之用。为使菌体获得充足的氧，一般装液量为三角瓶的10%以下。有时为提高搅拌效果，增加通气量，也可在三角瓶内设置挡板或添加玻璃珠等。将摇瓶放在摇瓶机上以一定速度保温震荡培养。此法在实验室广泛用于微生物的生理生化试验、发酵和菌种筛选等，发酵工业中用于种子培养。
4.台式发酵罐 实验室用的发酵罐一般为几升到几十升。商品发酵罐的种类很多，一般都有多种自动控制和记录装置。如配置有pH、溶解氧、温度和泡沫检测电极，有加热或冷却装置，有补料、消泡和pH调节作用的酸或碱储罐及自动记录装置，甚至计算机控制。
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