鞭毛的有无和着生方式在细菌的分类和鉴定中，是非常有价值的形态学指标。
在细菌中，球菌通常没有鞭毛，只有个别如动球菌属会生有鞭毛；杆菌中的假单细胞菌有端生鞭毛，其他长有周生鞭毛或者没有鞭毛；弧菌、螺菌类都是普遍生有鞭毛的。
鞭毛在细菌表面的着生方式是多样化的，主要有以下几种分类：
① 一端生：一根，例如霍乱弧菌；一束，例如荧光假单胞菌
② 两端生：一根，例如鼠咬热螺旋体；一束，例如红色螺菌
③ 周生：属于肠杆菌科的，如伤寒沙门氏菌、普通变形杆菌等；属于芽孢杆菌科的，如枯草芽孢杆菌、丙酮丁醇梭菌等
④ 侧生：例如反刍月形单胞菌
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