对于漆酶在白腐菌降解木质素中的作用问题上有两种不同的看法，一些研究者认为漆酶的作用很关键，它能参与许多溶木素必需的反应，能够降解酚型木质素底物，在特殊条件下也能氧化非酚型木质素底物，而且只要存在酚类物质或某些木素类底物，就能够将Mn2+氧化为Mn3+螯合物，这些螯合物在木质素降解中起着重要的作用；另一些研究者的实验却表明漆酶和锰过氧化物酶单独作用时都不能降解木质素，混合在一起却能有效地起协同作用。也有一些研究者认为漆酶在降解木质素时几乎不起作用，当微生物产漆酶的能力受到抑制时，对其降解木质素的能力没有影响。事实上，木质纤维素是由纤维素、半纤维素和木质素组成的结构复杂的材料，各种木质纤维素的组成和结构存在着很大的差别，木质素的降解又是一个复杂的多酶体系共同作用的结果，不同的人得到不同的实验结果是完全可以理解的。但是，无论如何，许多降解木质素的微生物都能产生漆酶这一现象说明，漆酶肯定以某种形式参与了降解过程。
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