大多数金属硫化矿如黄铜矿、辉铜矿、黄铁矿、黝铜矿、闪锌矿和某些金属氧化矿如铀矿、氧化锰矿难溶于稀硫酸等一般工业浸出剂。但人们可利用某些特殊微生物，在合适条件下将上述矿物中的金属用稀硫酸浸出。
用于生物浸出的微生物种类繁多，但主要可分为两大类：化能无机自养型和化能有机异养型。化能无机自养型细菌主要用于有色金属硫化物的氧化浸出，化能有机异养型中的真菌、藻类等主要用于从硅酸盐和碳酸盐矿物中提取金属，如浸金。
已研究过用于生物浸出的微生物有20多种，分布于硫杆菌属、钩端螺菌属、硫化杆菌属、硫化叶菌属、酸菌属、生金球菌属和硫球菌属等。其中比较重要的有以下几种：
1、硫杆菌属
硫杆菌属中最为重要的3个种为氧化亚铁硫杆菌、氧化硫硫杆菌和排硫硫杆菌。
（1）氧化亚铁硫杆菌
该菌是最常用的一种浸矿工程菌，革兰氏阴性、化能无机自养细菌。靠氧化二价铁离子和还原态硫获得能源。它栖居于含硫温泉、硫和硫化矿矿床、煤、含金矿矿床及硫化矿矿床氧化带中，能在上述矿的酸性矿坑水中存活。菌体呈短杆状，细胞大小为直径0.3—0.5um，长 1.0—1.7um，在pH1.0—6.0范围内生长良好，最适生长pH范围为2.0—3.0，在2—40°下都能存活，但最适生长温度为28—35°。它可以氧化几乎所有已知的硫化矿物（辰砂矿和辉铋矿除外）、元素硫、其他还原性硫化合物及二价铁。它氧化二价铁的速率比在同样条件下空气中的氧的纯化学氧化速率快200000倍，氧化黄铁矿速率增加1000倍，氧化其他硫化物的速率可增加数十到数百倍。
（2）氧化硫硫杆菌
该菌常栖居于硫和硫化矿矿床，菌体呈圆头短杆状，常以单个、双个或短链状存在，细胞大小为宽0.5um，长1.0um，最适生长pH范围为2.0—2.5，最适生长温度为28—30°。可以氧化元素硫和硫的一系列还原性化合物，不能氧化硫化物矿物。在菌体两端各有一油滴，可将培养基中的硫溶人油滴之中再吸人体内进行氧化，可产生较多的酸，并有较强的耐酸性能。研究还发现该菌能耐80—110V电压，抗电流密度4A/dm3。
（3）排硫硫杆菌
它是硫杆菌中较常见的一种，在液体硫代硫酸盐培养基上能生成小而圆的菌落。由于生成硫沉淀，菌落呈黄色。该菌通常只存活一星期左右，可将硫代硫酸盐氧化成元素硫，又将元素硫氧化成硫酸。
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