微生物饲料包括青贮饲料、糖化发酵饲料、单细胞蛋白和氨基酸添加剂饲料等。
（一）青贮饲料
把收割的鲜牧草或农作物的茎和叶等进行适当破碎后，放入并密封于青窖内，利用附着在青饲料上的多种微生物，在厌氧条件下进行发酵，产生乳酸等有机酸和醇类，杀灭有害杂菌，增加饲料营养。这种经过贮存的营养丰富的、易消化、多汁味、耐藏的饲料称为青贮饲料。
（二）糖化发酵饲料
糖化发酵饲料是以秸秆粉为主要原料，接种产生纤维素酶、木质素酶活性高的微生物，经过发酵，使营养成分增加，口感较好的饲料。接种的微生物主要是曲霉属、根霉属、毛霉属以及担子菌中的一些糖化酶活性较高的菌种，还有乳酸菌、酵母菌等。它们能水解淀粉、纤维素，产生糖类、有机酸和醇类，增加营养，改善口味，提高饲料的利用价值。
（三）单细胞蛋白饲料
单细胞蛋白营养丰富，含有多种氨基酸和维生素，是饲料中蛋白质的主要来源。许多原料可以用来生产单细胞蛋白，如食品加工厂的废液、废渣，农副产品的废弃物、禽畜粪便和生活垃圾等。用作生产菌种的微生物主要是不同类型的酵母菌、光合细菌等。
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