细菌的大小是细菌基本的形态特征，也是细菌分类鉴定的依据之一。微生物大小的测定，需要在显微镜下借助于特殊的测量工具——测微尺，包括目镜测微尺和镜台测微尺。
目镜测微尺是一块可放入接目镜内的圆形小玻片，其中央有精确的等分刻度，即将5mm长度刻成50等分或将10mm长度刻成100等分。测量时，需将其放在目镜中的隔皈上（此处恰好与物镜放大的中央物像重叠），用以测量经显微镜放大后的细胞物像。由于不同显微镜或不同的目镜和物镜组合放大倍数不同，目镜测微尺每小格所代表的实际长度也不一样。因此，用目镜测微尺测量细菌大小时，必须先用镜台测微尺进行校正，以求出该显微镜在一定放大倍数的目镜和物镜下，目镜测微尺每小格所代表的相对长度。然后根据细菌细胞相当于目镜测微尺的格数，再计算出细胞的实际大小。
镜台测微尺是中央部分刻有精确等分线的载玻片，一般是将1mm等分为100等分，每格长0.01mm。镜台测微尺并不直接用来测量细胞的大小，而是用于校正目镜测微尺每格的相对长度。校正时，将镜台测微尺放在载物台上，由于镜台测微尺与细菌标本处于同一位置，都需经物镜和目镜的两次放大成像进入视野，即镜台测微尺随着显微镜总放大倍数的放大而放大。因此从镜台测微尺上得到的读数就是细菌的真实大小，所以用镜台测微尺的已知长度在一定放大倍数下校正目镜测微尺，即可求出目镜测微尺每格所代表的实际长度，然后移去镜台测微尺，换上待测标本片，用校正好的目镜测微尺在同样放大倍数下测量细菌的大小。
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