一、裸甲藻属
裸甲藻属：藻体单细胞，卵圆形，无细胞壁，横沟位于细胞中部，环状或稍向左旋。营浮游生活，运动时呈左右摇摆状。细胞长15.6—31.2um，宽13.2—24um。下椎部的底部中央有明显的凹陷，右侧底端略长于左侧。鞭毛2条，从横沟和纵沟相交处的鞭毛孔伸出。色素体多数，盘状、狭椭圆状或棒状，周生或辐射状排列，呈黄色、褐色、绿色或蓝色，有些种类无色素体。
世界广布种，常见于温带和热带浅海水域，温暖季节易大量繁殖，形成“赤潮”。
二、角甲藻属
角甲藻属植物体为单细胞，明显不对称。藻体长，前后延伸，上体部长，略呈等腰三角形，细胞前、后端都延伸成为长的角。顶角一个，后角2—3个，个。体长为100—200um，宽为30—50um。顶角与上体部无明显分界线。横沟部位最宽，呈环状，平直，细胞腹面中央为斜方形。鞭毛2条，从横沟和纵沟相交处的鞭毛孔伸出。色素体多数，周生，呈圆盘状，黄色、黄绿色、褐色。
世界性分布，典型的沿岸表层性种，广泛分布于热带和寒带海洋，是渤海、东海和南海习见种，在养鱼池有时形成红色水华。
三、多甲藻属
多甲藻属植物体为单细胞，细胞形状多样，球形，椭圆形、卵形等。细胞壁厚，甲片缝常很清楚，甲片上有小刺和隆起的网纹。鞭毛2条，从横沟和纵沟相交处的鞭毛孔伸出。色素体多数，周生，颗粒状、圆盘状，呈黄色、褐色。
四、薄甲藻属
薄甲藻属植物体为单细胞，球形、卵形、圆锥形，上壳和下壳等大或不等大，横沟环状或略呈螺旋状环绕，纵沟明显，位于腹面。胞壁厚，整块或由大小不等 的多角形板片组成，板片平滑，具点纹、线纹或乳头状突起 。鞭毛2条，从横沟和纵沟相交处的鞭毛孔分别伸出，色素体多数，圆盘状、卵形，呈金色、黄绿色、褐色，少数种类五色素体。
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