预防流感的一般措施，主要是加强自身锻炼增强免疫力。在流感流行期间应尽量避免人群聚集，必要时应戴口罩。公共场所可用乳酸加热薰蒸进行空气消毒。通常每100m3空间可用2—4ml乳酸加10倍水混匀，加热薰蒸。疫苗接种是预防流感最有效的方法，但必须与当前流行株的型别基本相同，才有特异性预防作用。
流感疫苗有灭活疫苗和减毒活疫苗两种。目前WHO推荐的灭活疫苗包含甲、乙型和多种亚型流感病毒株的抗原，如WHO推荐的20032004年流感病毒裂解疫苗包含甲/莫斯科/（99H3N2）、甲/新喀里多尼亚/（99H1N1）、乙/香港/2001三种毒株的抗原。推荐用于成人和6个月以上儿童。灭活疫苗的优点是经皮下注入，可产生大量的lgG，副作用小，适用于年老体弱者。缺点是局部slgA产生少，接种次数多。减毒活疫苗采用鼻咽腔喷雾法接种，操作简单方便，接种局部产生较多slgA，但副作用大，类似轻症感染。
国内外对流感病毒HA和NA亚单位疫苗及基因工程疫苗正在研制中。
对流感尚无特效药物，主要是对症治疗和预防继发性细菌感染。抗病毒药金刚烷胺及其类似物甲基金刚烷胺对甲型流感病毒有一定抑制作用，可用于流感的预防和早期治疗。其作用机制主要是抑制病毒的穿入和脱壳。此外，干扰素滴鼻及中药板蓝根、大青叶等也有一定疗效。
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