处理生物安全危害时，使用安全设施并结合规范的操作将有助于降低危险。
实验室主任应咨询生物安全官员和安全委员会（如果有），确保配备足量的设备，并能正确使用。选择设备时应符合一些基本原则，即：
1、在设计上应能阻止或限制操作人员与感染性物质间的接触
2、建筑材料应防水、耐腐蚀并符合结构要求
3、设备装配后应无毛刺、锐角以及易松动的部件
4、设备的设计、建造与安装应便于操作、易于维护、清洁、清除污染和进行质量检验。应尽量避免使用玻璃及其他易碎的物品。
基本生物安全设备
1、移液辅助器——避免用口吸的方式移液。有不同设计的多种产品可供使用。
2、生物安全柜，在以下情况使用：
（1）处理感染性物质；如果使用密封的安全离心杯，并在生物安全柜内装样、取样，则这类材料可在开放实验室离心
（2）空气传播感染的危险增大时
（3）进行极有可能产生气溶胶的操作时（包括离心、研磨、混匀、剧烈摇动、超声破碎、打开内部压力和周围环境压力不同的盛放有感染性物质的容器、动物鼻腔接种以及从动物或卵胚采集感染性组织）。
3、一次性塑料接种环，也可在生物安全柜内使用电加热接种环，以减少生成气溶胶。
4、螺口盖试管及瓶子。
5、用于清除感染性材料污染的高压灭菌器或其他适当工具。
6、一次性巴斯德塑料移液管，尽量避免使用玻璃制品。
7、在投入使用前，像高压灭菌器和生物安全柜等设备必须用正确方法进行验收。应参照生产商的说明书定期检测。
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