1、根土比根土比是指单位植物根际土壤中微生物数量与邻近单位根外土壤中微生物数量之比。
2、植物病原微生物是指那些寄生或附生于植物根系、茎杆、叶面而从植物细胞中获得营养物质、水分，导致植物发生病害甚至死亡的微生物。
3、VA菌根是内生菌根的主要类型，是由于菌根菌丝在根皮层细胞内形成特殊的变态结构泡囊（Vesicule)和丛枝(Arbuscule),而用其英文打头字母得名。
4、内生菌根：在真菌与植物根系形成的菌根中真菌菌丝可以穿透根表皮层，进入皮层细胞间隙或细胞内，也有部分真菌菌丝可穿过菌根的表皮生长到根外，有助于扩大根的吸收，但主要是在皮层细胞间纵向延伸，或盘曲于皮层细胞内。这种菌根称为内生菌根。
5、外生菌根：是指菌根菌菌丝在植物根表面生长并交织成鞘套包在根外。鞘套外层菌丝结构疏松，并向外延伸使表面呈毡状或绒毛状，并代替根毛起吸收作用。内层菌丝可进入根皮层细胞间隙形成哈蒂氏网，但不进入皮层细胞内。
6、菌根菌：是指能与植物形成共生联合体菌根的真菌 。
7、植物根际：是指在植物根系影响下的特殊生态环境，一般指距根表2mm以内的土壤范围称为根际。
8、植物根际微生物：是指处于植物根际这个特殊生态环境中的微生物区系。
9、微生物寄生：在微生物寄生关系中，凡被另一类微生物寄生于体表或体内，细胞物质被另一类微生物获取为营养，最后发生病害甚至被裂解死亡的这一过程称为微生物寄生。
10、微生物寄生物：在微生物之间的寄生关系中，凡寄生于另一类微生物体表或体内，并从另一类微生物细胞中获取营养而生存的微生物，称为微生物寄生物。
11、根瘤：是豆科植物与根瘤菌相互作用而形成的植物---------根瘤菌共生体，具有固氮作用的特殊结构。
12、微生物之间的接力关系：是指微生物在分解复杂大分子有机物质时需要有多种微生物协同完成，在这个过程中，乙种微生物以甲种微生物代谢产物为营养基质，而丙种微生物又以乙种微生物的代谢产物为营养基质，如此下去，直至彻底分解，这种微生物之间的关系称为接力关系
13、微生物之间的捕食关系：是一种微生物吞食或消化另一种微生物的现象，如原生动物捕食细菌，放线菌和真菌孢子等。
14、微生物之间的共生关系：是两种微生物紧密地结合在一起，形成特定结构的共生体，两者绝对互为有利，生理上发生一定的分工，且具有高度专一性，其他微生物种一般不能代替共生体中的任何成员。且分开后难以独立生活，但不排除在另一生境中独立生活。
15、微生物之间的互利共栖关系：是指在同一个环境中两个微生物类群共栖时，双方在营养提供或环境条件方面都得益的关系。
16、微生物之间的偏利互生关系：这种关系是指在一个生态系统中的两个微生物类群共栖，一个群体得益，而另一个群体既不得益也不受害的情况。
17、微生物之间的寄生关系：是指一种微生物生活在另一种微生物的表面或体内，并从后一种微生物的细胞中获取营养而生存，常导致后一种微生物发生病害或死亡的现象。
18、微生物之间的拮抗关系：是两种微生物生活在一起时，一种微生物产生某种特殊的代谢产物或改变环境条件，从而抑制甚至杀死另一种微生物的现象。
19、微生物之间的竞争关系：是指两个或多个微生物种群生活于同一环境中时，竞争同一基质，或同一环境因子或空间而发生的其中一方或两方的群体大小或生长速率受到限制的现象。
20、土壤微生物生物量：是指单位土壤(m3或kg)中微生物细胞的重量。
21、微生物生态系：即是在某种特定的生态环境条件下，微生物的类群、数量和分布特征，以及参与整个生态系中能量流动和生物地球化学循环的过程和强度的体系。
22、发酵性微生物区系：是指土壤中那些对新鲜有机质很敏感，在有新鲜有机质存在时，可爆发性地旺盛发育，而在新鲜有机质消失后又很快消退的微生物区系，其数量变幅很大。
23、土著性微生物区系：是指土壤中那些对新鲜有机物质不很敏感，常年维持在某一水平上，即使由于有机物质的加入或温度、湿度变化而引起的数量变化，其变化幅度也较小的微生物类群。
24、清水型水生微生物：主要是指那些能生长于有机物质不丰富的清水中的化能自养型和光能自养型的微生物，如硫细菌、铁细菌、蓝细菌等。
25、腐生型水生微生物：是指那些能利用进入水域的腐败有机残体、动物和人类排泄物，生活污水和工业有机废水为营养，转化这些有机物为无机态物，使水质净化变清，而微生物本身得到大量繁殖的一类微生物。
26、土壤微生物区系：是指在某种特定的环境和生态条件下的土壤中存在的微生物种类、数量以及参与物质循环的代谢活动强度。
27、土壤微生物区系分析：采用多种培养基和培养方法，培养土壤中微生物区系的各个组成成分，从而认识特定土壤中的微生物区系在数量上和类群上的特点，即为土壤微生物区系分析。
28、极端环境微生物：能生存于极端环境如高温、低温、高酸、高碱、高压、高盐等环境中的微生物。
29、微生物生态学：就是研究处于环境中的微生物和与微生物生命活动相关的物理、化学和生物等环境条件，以及它们之间的相互关系的科学。
30、生态学：是研究生物有机体与其栖居环境相互关系的科学。
31、水体的富营养化：是指水体中氮、磷元素等营养物的大量增加，远远超过通常的含量，结果导致原有生态系统的破坏，使藻类和某些细菌的数量激增，其他生物种类减少。
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