十三、碘和碘伏
这类消毒剂的作用与氯类似，只是有机质对它们的抑制作用略弱。碘可以使纤维和环境表面着色，一般不适合作为消毒剂。但是，碘伏和碘酊是很好的抗菌剂。多聚碘（polyvidone iodine）是一种安全可靠的外科手术擦手剂和手术前皮肤抗菌剂。碘类抗菌剂一般不适于医疗／牙医器械的消毒。碘不能在铝或铜上使用。
碘有毒性。含有有机碘的产品必须于4～10℃储存，以避免有潜在危害性的细菌在里面生长。
十四、过氧化氢和过氧乙酸
像氯一样，过氧化氢（H2O2）和过氧乙酸（CH3COOOH）是强氧化剂，是一种广谱杀菌剂。对人和环境它们较氯更为安全。
通常供应的过氧化氢是可以立即使用的3％的溶液，或是用无菌水稀释5～10倍体积后使用的30％的水溶液。但是，那种单独含有3～6％过氧化氢的溶液杀菌作用缓慢而有限。现有产品中含有其他成分来稳定过氧化氢，加速其杀菌作用并降低其腐蚀性。
过氧化氢能够用于清除实验台和生物安全柜工作台面的污染，较高浓度的溶液适于清除对热敏感的医疗∕牙医器械的污染。采用过氧化氢或过氧乙酸熏蒸来消毒对热敏感的医疗／牙医器械时，需要特殊的设备。
过氧化氢和过氧乙酸能腐蚀铝、铜、黄铜和锌等金属，也能使纤维、头发、皮肤及黏膜褪色。经它们处理的物品必须经过彻底的漂洗后才能接触眼睛和黏膜。它们应当储存在避热和避光的地方。
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