根据安斯沃思(Ainsworth 1971,1973)的分类系统,运用世界上主要依据的伯杰(Bergey’s 1923~1957)细菌鉴定法和洛德(Lodder 1970)的酵母菌等鉴定法分类鉴定表明,能源性微生物的主要种类是:
甲烷产生菌的主要种类有甲烷杆菌属(Methanobacterium)、甲烷八叠菌属(Methanosarcina)、甲烷球菌属(Methanoccus)等。
乙醇产生菌的主要种类有酵母菌属(Saccharomyces)、裂殖酵母菌属(Schizosaccharomyces)、假丝酵母属(Candida)、球拟酵母属(Torulopsis)、酒香酵母属(Brettanomyces)、汉逊氏酵母属(Hansenula)、克鲁弗氏酵母属(Kluveromyces)、毕赤氏酵母属(Pichia)、隐球酵母属(Cryptococcus)、德巴利氏酵母属(Debaryomyces)、卵孢酵母属(Oosporium)、曲霉属(Aspengillus)等。
氢气产生菌的主要种类有红螺菌属(Rhodospirillum)、红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)、红微菌属(Rhodomicrobium)、荚硫菌属(Thiocapsa)、硫螺菌属(Thiospirillum)、闪囊菌属(Lamprocystis)、网硫菌属(Thiodictyon)、板硫菌属(Thiopedia)、外硫红螺菌属(Ectothiorhodospira)、梭杆菌属(Fusobacterium)、埃希氏菌属(Escherichia)、蓝细菌类等。
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