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嗜酸乳杆菌推定的β-半乳糖苷酶基因在大肠杆菌中的功能性表达



录入时间:2011-3-8 14:02:41 来源:中国知网

【摘要】  目的 在大肠杆菌中诱导表达以嗜酸乳杆菌克隆β半乳糖苷酶基因lacZ,为研究其酶学特性做准备。方法 从嗜酸乳杆菌ATCC 4356中克隆lacZ基因,并构建表达载体pET22blacZH、pQE31HlacZ和pQE31lacZ,然后在大肠杆菌中诱导表达,并测定表达产物的β半乳糖苷酶活性。结果 无标签的重组嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶LacZ获得了功能性表达,表达量可达2.28 kU/L.而融合HisTag的重组嗜酸乳杆菌LacZ却失去了β半乳糖苷酶活性,即使复性也不能恢复。结论 克隆表达的成功为该酶的酶学性质研究和可能的应用打下了基础。
【关键词】  嗜酸乳杆菌; β半乳糖苷酶; 克隆表达; HisTag;复性
    【Abstract】  Objective To clone and express the lacZ gene of L. acidophilus in E. coli for research of the properties of the putative βgalactosidase. Methods  The lacZ gene was cloned from L. acidophilus ATCC 4356 and was inserted into three recombinant vectors: pET22blacZH, pQE31HlacZ and pQE31lacZ. The recombinant proteins were induced and were identified by SDSPAGE and βgalactosidase assay. Results The recombinant lacZ without tag was expressed as functional βgalactosidase, which yield was 2.28 kU/L, but the two recombinant LacZs with Histag were expressed as proteins without activity and its activity could not recovery by renaturation. Conclusion The study make a base for research of enzymatic properties and probable application in the future.
    【Key words】  Lactobacillus acidophilus;  βgalactosidase;  expression;  HisTag;  renaturation
    β-半乳糖苷酶(βgalactosidase,EC 3.2.1.23)因为能水解牛奶中的乳糖而广泛的应用于乳品工业[1,2],又因为便利的显色反应而普遍应用于分子生物学研究[3,4]。寻找新的β半乳糖苷酶可以促进分子生物学研究和乳品工业发展。
    最近嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)NCFM菌株基因组DNA(GenBank accession No. CP000033)已完成测序[5]。该菌基因组携带有3个推定的β半乳糖苷酶编码基因:lacA、lacZ和lacLM。已知lacLM基因编码的β半乳糖苷酶是该菌降解乳糖的主要酶[6,7],而lacZ基因却功能不明。迄今为止,还没有关于该基因编码产物的研究报道。嗜酸乳杆菌lacZ基因和著名的大肠杆菌(Escherichia coli)lacZ基因虽然同名,其序列却没有相似性。该基因相似于极端环境微生物的属于糖苷水解酶42家族(glycoside hydrolase family 42,GH42)的β半乳糖苷酶基因。极端环境微生物中的GH42 β半乳糖苷酶因耐热[8]、耐盐[9]、耐低温[10]或有特殊的底物而受到关注。嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶LacZ可能同极端环境微生物的GH42 β半乳糖苷酶一样,具有某种独特的性质,从而应用于分子生物学研究或乳品工业。
    本实验设计了3个克隆表达载体,试图在大肠杆菌中大量表达嗜酸乳杆菌GH42β半乳糖苷酶LacZ,旨在为后续的酶学性质研究提供依据。
   材料与方法
    1.1  菌株和质粒
    嗜酸乳杆菌ATCC 4356购自中科院微生物研究所菌种保藏库,培养条件为:在37 ℃下,于MRS培养液[6]中静置培养24~48 h.大肠杆菌JM109和Rosetta菌株是本实验室保存,培养条件为:在37 ℃下,于LB培养液中摇振培养过夜。选用本实验室保存的质粒pET22b和pQE31为表达载体。筛选条件为100 μg/ml的氨苄青霉素。
    1.2  嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶基因的PCR扩增
    嗜酸乳杆菌基因组DNA的提取方法参考文献[11]。用嗜酸乳杆菌ATCC 4356的基因组DNA为模板,加入下列引物扩增嗜酸乳杆菌lacZ基因: P1:5′CAGGATCCGATGACACAATTATCACG
    TTTTC3′;P2:5′GGCTCGAGATTTCTCAATA
    CTTGAACATCC3′;P3:5′GCCTGCAGCTAAT
    TTCTCAATACTTGAACATCC3′;P4:5′CCGA
    ATTCTAGAGGAAATAAAATGACACAATTA
    TCACG3′.P1和P2扩增的是不带终止密码子的lacZ基因的编码序列,扩增片段长2 018 bp;P1和P3扩增的是带有终止密码子的lacZ基因编码序列,扩增片段长2 021 bp;P4和P3扩增的是从lacZ的RBS到终止密码子之间的序列,扩增片段长2 033 bp.PCR反应条件:94 ℃预变性5 min;95 ℃变性40 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸130 s,共20个循环;最后72 ℃延伸10 min.凝胶电泳检测PCR结果,PCR纯化试剂盒回收目的条带。
    1.3  嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶表达载体构建
    分别用对应的内切酶对PCR产物和载体进行双酶切,胶回收后用T4DNA连接酶连接,再将连接产物电转化入宿主菌株。共构建3个重组质粒(见图1):(a)是pET22blacZH,由P1和P2扩增的片断和pET22b连接构成,lacZ基因置于T7启动子控制下,5′端带有果胶酶信号肽序列,3′端带有HisTag.转化Rosetta菌株,以含氨苄青霉素的LB平板筛选。(b)是pQE31HlacZ,由P1和P3引物对扩增的片断和pQE31连接而成,lacZ基因置于T5启动子控制下,5′端带有HisTag.(c)是pQE31lacZ,由P4和P3引物对扩增的片断和pQE31连接而成,lacZ基因置于T5启动子控制下,自带RBS位点,5′端和3′端没有任何标签和多余序列。(b)和(c)转化JM109菌株,以含氨苄青霉素、XGal和IPTG的LB平板筛选。双酶切和PCR初步鉴定重组质粒,并送上海生工公司测序鉴定。
    1.4  重组嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶的诱导表达
    诱导方案为:诱导温度设为37 ℃、30 ℃、25 ℃和20 ℃;诱导剂IPTG浓度设为:0.1、0.2、0.4、0.6和0.8 mmol/L;培养基设为含0.5 %乳糖的LB培养基和普通LB培养基。120 r/min摇床培养重组菌株pET22blacZH/Rosetta、pQE31HlacZ/JM109和pQE31lacZ/JM109各10 ml,培养至OD600≈0.6,加IPTG诱导8 h.取3 ml表达菌液,6 000×g离心2 min收集菌体,再用300 μl ddH2O将菌体混悬均匀,在冰上用超声波破碎菌体,12 000×g离心30 min,收集上清液测定其β半乳糖苷酶比活力。重悬的超声沉淀、超声上清液和重悬的菌体一并做SDSPAGE分析。用Bradford法测定蛋白质浓度。
    1.5  重组β半乳糖苷酶的酶活性测定
    酶活性测定方法根据文献[12]修改:在200 μl反应液(22 mmol/L ONPG,50 mmol/L Na3PO4,pH 6.6)中加入10 μl适当稀释的试验样品,37 ℃温育10 min后,加入450 μl浓度为0.4 mol/L的Na2CO3溶液终止反应,于420 nm处测定OD值。设定在该反应条件下,每分钟释放1 μmol邻硝基苯酚为1个酶活单位(U)。
    1.6  包涵体表达的重组β半乳糖苷酶的提取和复性
    根据诱导表达实验结果,在37 ℃培养构建的3株重组菌株各500 ml,加终浓度为0.4 mmol/L的 IPTG诱导表达8 h,然后离心收集表达菌体,用buffer A(50 mmol/L Tris·Cl, 50 mmol/L NaCl,0.5 mmol/L EDTA,5 %甘油,pH 8.0)洗涤后,在冰浴中超声破菌。然后按照文献[13]的描述,用Triton X100提取和洗涤包涵体,再用尿素溶解包涵体。将包涵体溶解液在逐渐降低变性剂浓度的溶液中透析复性:透析液Ⅰ(2 mol/L尿素,20 mmol/L Tris·Cl,0.1 mmol/L GSSG,0.9 mmol/L GSH, pH 8.0),透析液Ⅱ(0.5 mol/L尿素,20 mmol/L Tris·Cl,0.1 mmol/L GSSG,0.9 mmol/L GSH,pH 8.0),透析液Ⅲ(50 mmol/L Tris·Cl,50 mmol/L NaCl,1 mmol/L EDTA,70 μl/L β巯基乙醇,pH 8.0)。SDSPAGE电泳和β半乳糖苷酶活性测定检测效果。用Bradford法测定蛋白质浓度。
结果
    2.1  嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶基因的表达载体
    以嗜酸乳杆菌基因组DNA为模板的3个PCR均得到了预期条带。酶切、连接和电转化后,均筛选到了转化子。其中pQE31lacZ/JM109的转化子在筛选平板上呈现为蓝色菌落;而pQE31Hlac Z/JM109的转化子在筛选平板上仍然呈现为白色菌落。这个现象提示pQE31lac Z/JM109菌株表达了有活性的重组β半乳糖苷酶,而pQE31Hlac菌株表达的重组β半乳糖苷酶可能没有活性。双酶切、PCR(见图2)及测序证实3种重组质粒pET22blacZH、pQE31HlacZ和pQE31lacZ均构建成功。测序表明克隆序列和嗜酸乳杆菌NCFM菌株lacZ序列100 %相同。序列提交GenBank,登录号为:EU590652.
    2.2  重组嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶的表达形式
    经检测,在各诱导条件下,菌株pET22blacZH/Rosetta的超声上清液的β半乳糖苷酶比活力和对照菌株(pET22b /Rosetta)超声上清液的β半乳糖苷酶比活力都没有显著区别,表明该重组菌株很可能不表达有活性的重组LacZ.SDSPAGE结果显示在全菌样品和超声沉淀样品中均存在一个显著的约70 kDa(接近嗜酸乳杆菌LacZ的理论分子量76 583 Da)的表达条带,但是在超声上清液中却没有明显的70 kDa表达条带(见图3B)。因此判定C端融合HisTag的重组LacZ的表达形式为包涵体表达。
    pQE31HlacZ/JM109在各诱导条件下的超声上清液中都测不到β半乳糖苷酶酶活,表明该重组菌株不能表达有活性的重组LacZ.SDSPAGE显示了和pET22blacZH/Rosetta相似的结果(见图3A),因此判定N端融合HisTag的重组LacZ的表达形式也为包涵体表达。
    pQE31lacZ/JM109在各诱导条件下均能在超声上清液中检测到β半乳糖苷酶酶活性,说明该菌株实现了无标签重组LacZ的可溶性表达。在诱导条件为25 ℃、0.4 mmol/L IPTG和含0.5 %乳糖的LB培养基时,超声上清液中β半乳糖苷酶活性最高,比活力达到1.14 U/mg。据此推算,诱导后菌液中的β半乳糖苷酶单位约为2.28 kU/L.SDSPAGE显示在超声上清液中有明显的表达条带(见图3D)。不过在37 ℃下却主要为包涵体表达,超声上清液中的表达条带减弱(见图3C)。相应的,超声上清液的β半乳糖苷酶比活力也下降到0.18 U/mg.
    2.3  包涵体表达的重组蛋白的复性
    C端标记LacZ经透析复性后,测得复性后的目标蛋白溶液的浓度为0.43 mg/ml.酶活性测定表明复性蛋白没有β半乳糖苷酶活性。N端标记LacZ经透析复性后,测得复性后的目标蛋白溶液的浓度为0.35 mg/ml.酶活性测定表明复性蛋白也没有β半乳糖苷酶活性。而无标签重组LacZ经透析复性后,测得复性后的目标蛋白溶液的浓度为1.16 mg/ml.酶活性测定表明复性蛋白溶液β半乳糖苷酶活性含量为10.1 U/ml,比活力为8.72 U/mg.
   讨论
    重组菌株pQE31lacZ/JM109在筛选板上长出蓝色菌落;诱导后,其超声上清液具有β半乳糖苷酶活性(1.14 U/mg,25 ℃),SDSPAGE图上显示了明显的重组嗜酸乳杆菌LacZ条带(70 kDa);表达为包涵体的重组嗜酸乳杆菌LacZ也复性成功(8.72 U/mg)。这一组实验结果表明无标签的重组嗜酸乳杆菌LacZ实现了功能性表达。
    重组菌株pQE31HlacZ/JM109和pET22blacZH/Rosetta虽然都在SDSPAGE图上显示了明显的重组嗜酸乳杆菌LacZ条带(70 kDa),但是在超声上清液中却没有重组β半乳糖苷酶活性。这说明重组蛋白的表达形式是包涵体。在包涵体复性实验中,两种重组β半乳糖苷酶(HLacZ和LacZH)都不能测得酶活性。说明这两种重组β半乳糖苷酶都没能重折叠为有活性的构象。比较无标签重组LacZ的成功复性,作者推论,很可能是融合的HisTag阻碍了重组蛋白的正确折叠。利用NCBI网站的保守结构域检索工具进行检索,发现嗜酸乳杆菌LacZ的C端和N端均存在保守结构域,分别称为GH42 β半乳糖苷酶N端结构域和GH42 β半乳糖苷酶C端结构域。显然HisTag对这两个结构域的影响是复性失败的可能原因。
    重组质粒pQE31lacZ的克隆方式是独特的。该克隆方式可确保重组蛋白的氨基酸序列不会因克隆带上附加序列。如果只利用pQE31质粒多克隆位点(MCS)的酶切位点构建重组质粒,表达的重组蛋白的N端将带上有利于纯化的HisTag.但是HisTag有可能会影响重组蛋白的活性。如果利用pQE31质粒lacO与RBS之间的Eco R I酶切位点和MCS上的任意酶切位点构建重组质粒,就能切掉pQE31质粒的HisTag和RBS位点。在目标片段上带上RBS,表达的重组蛋白将没有任何附加的氨基酸残基,这就确保不会因克隆而导致重组蛋白不同于亲本蛋白。若为了研究蛋白的活性而进行的克隆,显然这个克隆策略最好。
    嗜酸乳杆菌β半乳糖苷酶LacZ和极端环境微生物的GH42 β半乳糖苷酶属于同一糖苷水解酶家族,很可能该酶像极端环境微生物的GH42 β半乳糖苷酶一样具有令人感兴趣的酶学特性。目前还没有该酶的克隆表达报道。本文设计了3个表达载体,表达了3种重组LacZ,分别为N端标记HisTag、C端标记HisTag和无标签的重组LacZ.其中无标签重组LacZ实现了功能性表达,为该酶的酶学性质研究和可能的应用打下了基础。
作者:潘渠  胡福泉  陈恬  邱岳  王广科  李晋川《成都医学院学报》
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