1）前增菌。使受伤菌得到修复。一般镁离子和0.1%蛋白胨水。有氧代谢时还加0.2%的丙酮酸钠。增菌时间因菌而异。
2）增菌。加入适当选择剂和刺激目的菌生长的物质，并使目的菌生长适合的温度、酸碱度、渗透压、氧化还原电位调节剂，使杂菌得到抑制，目的菌得到充分增殖，成为优势菌。以下是沙门氏菌检验中使用不同选择剂获得的选择效果。
3）使用一种或两、三种选择强度不同的选择性平板分离目的菌。
4）对选择性平板上挑选的可凝菌落最好在选择性平板或非选择性平板上进行划线分离纯化。
5）对选择性平板上挑选的可凝菌落进行生理特性和生化特征鉴定，同时进行血清学鉴定。有时先进行血清学鉴定后再进行生化鉴定，以加快检验速度。必要时进行动物试验，以确认致病菌。
由于目的菌的性状有可能因噬菌体感染等原因发生变异，加上有一些细菌虽然存在，但尚未被发现和确认，因此在进行致病菌鉴定时要尽可能多做几项生化试验。
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