3 细菌耐药性监控 与国外相比，我国细菌耐药监测工作还存在较大差距，一方面，国内此项工作开展不够普遍；另外有些监测工作还缺乏规范性的连续性，我们不仅要进行各医院的监测，还要协助有关部门进行地区性监测，甚至全国范围的监测，进一步与国际接轨和交流，鉴于目前耐药性的问题。鉴于目前耐药性的问题日趋严重，应准确地做好常规的抗生素敏感试验，并保存有关的菌种和数据以便进一步分析，包括耐药趋势的统计分析、耐药机制的检测和研究，重点耐药菌株如MR-SA、VRE和ESBL等的监测和耐药基因的检测等。
4．帮助临床合理应用抗生素 过去细菌学检验工作只注重准确的细菌学报告，不太关心临床实际的治疗效果，注重准确的细菌学结果固然重要，但这不应是我们工作的全部，检测病原微生物对抗生素的敏感性是临床微生物实验室最重要的任务之一。抗生素敏感性检测的主要目的是预测抗生素的治疗效果，并帮助临床医生针对某一特定的临床感染问题选择最合适的药物。临床微生物工作者不仅要求用正确、迅速的手段检出病原体，而且要给临床提供可能存在的耐药机制，帮助临床合理应用抗生素。
5 临床（咨询）服务 目前备受人类重视的难治的耐药菌有：
①耐青霉素肺炎链球菌（PRP）；
②耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌（MRSA）；
③耐万古霉素肠球菌（VRE）；
④耐万古霉素葡萄球菌（VRSA）；
⑤耐多种药物的结核分枝杆菌（MDR-TB）；
⑥真菌感染日益增多；⑦产超广谱β-内酰胺酶的革兰阴性杆菌（ESBL）；
⑧持续高产染色体I型β-内酰胺酶（AmpC）的阴沟肠杆菌、产气肠杆菌，弗劳地枸橼酸杆菌；
⑨多重耐药的铜绿假单胞菌，不动杆菌和嗜麦芽窄食单胞菌。微生物学检测的目的要求我们加强与临床沟通，协助临床医生解决治疗感染性疾病的困难。
新世纪临床微生物学受到重大挑战之一是出现了许多新病原体及其引起的新传染病。人们对新传染病的认识和准备不足，缺乏有效的预防、诊断和治疗措施，人群缺乏相应的免疫力，往往造成新传染病传播快、范围广，传播途径多，常造成巨大的经济损失和社会影响。
用抗菌药物治疗的患者更新世纪临床微生物学受到的挑战之二是细菌的耐药现状：
①由转移性VanA介导的MRSA对万古霉素耐药性的报道令人不安，因为治疗此类细菌感染的耐药物只剩下一些较新的药物，如：吗啉恶酮（Imezolid）以及部分新的头孢菌素。
②多重耐药的革兰阳性菌-21世纪的MRSA，而更多耐药的不动杆菌和铜绿假单胞菌比MRSA和VRE更为严重。
③耐多种药物的结核分枝杆菌（MDR-TB），MDR-TB是指对两种或两种以上的抗结核药物耐药的结核分枝杆菌。近10年来，全球结核病形势急剧恶化，据世界卫生组织估长时期，全球已有20亿人受结核菌的感染，现有结核病人约2000万，结核已成为传染病的头号杀手。
④念珠菌感染逐年增多，念珠菌感染成了人类又一主要杀手，特别是在引起医院感染的病原菌中具重要地位，外伤、烧伤、营养不良，器官移植，糖尿病，肾功能衰竭，血液病，粒细胞减少，以及长期大量应用抗菌药物治疗的患者更易出现念球菌感染。念珠菌血症的患者死亡率在25%~57%（平均为38%），因此，念珠菌感染的早期诊断和及时治疗成为一项极为紧迫的任务。
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