1、细菌：是单细胞生物，有球形，杆状和螺旋形三种。在废水处理过程中起主要作用的是由多种细菌所组成的菌胶团。细菌在适宜的环境中，每20~30min可裂殖一次，生成2个细菌。
2、丝状菌：是一大类菌体细胞相连而形成丝状的微生物的总称，也称为丝状微生物。包括丝状细菌、丝状真菌和丝状藻类等微生物群。丝状菌在废水生化处理过程中是活性污泥絮体的主要骨架材料。如丝状菌数量不足，则无法形成活性污泥絮体，不能进行高效的泥水分离。从而无法获得清澈的上清液，使出水浑浊。但当丝状菌过多时，会导致活性污泥膨胀。
3、原生动物：在废水活性污泥处理法中，原生动物主要有三类：肉足类、鞭毛类和纤毛类。分别有代表生物变形虫、鞭毛虫和纤毛虫。
4、后生动物：由多个细胞组成，种类很多，常见的有轮虫和钟虫。
A、按微生物营养来源不同分
异养微生物：以有机物为营养源，利用有机物分解过程中产生的能量作为生命所需的能量来源。
自养微生物；利用无机物质作为营养，又分为化能自养和光能自养微生物。
B、按微生物的呼吸类型分
好氧微生物：生活在有氧环境，有氧生存，无氧则死亡，在有氧条件下可将有机污染物分解成CO2和H2O，此过程称为好氧分解。
厌氧微生物：生活在无氧环境，无氧生存，有氧则中毒死亡，在无氧条件下，能将复杂的有机物分解成有机酸等简单的有机物和CO2，此过程称为厌氧分解。
兼性微生物：既能在有氧环境生存，有能在无氧环境生存，有氧进行有氧呼吸，无氧则进行厌氧呼吸。废水处理系统中的绝大部分微生物均是兼性微生物。
微生物的新陈代谢
1 包括同化作用和异化作用两个方面。实质上就是微生物将废水中的有机污染物作为食物吸收分解掉，转化为水和二氧化碳的过程。
2 代谢的具体过程：吸附、扩散、水解、代谢
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