同一生态环境和中的各种生物之间相互影响。互为环境，相互联系，相互依赖，相互制约，相互影响。
一般表现为：互生、共生、竞争、拮抗、寄生、猎食六种关系。
一、互生关系：
是指二种可以单独生活的生物，当它们共同生活在一起时，相互有利或者一种生物生命活动的结果为另一种生物创造了有利的生活条件。
如：① 分解纤维素的细菌和固氮菌之间。
分解纤维素细菌分解纤维素产生有机酸，固氮菌不能利用纤维素，而利用有机酸为硫源，进行固氮，固定的氮被纤维细菌利用。
② 土壤表层的好氧微生物和厌氧生物之间。
好氧微生物利用氧气为厌氧微生物创造条件。
③ 根际微生物与高等植物之间。
根际：跟系周围的土壤里根际中生活的微生物叫根际微生物。根的脱落物及分泌物为根际微生物提供有机质。根际微生物加速有机质愤激外，或固氮为微生物提供无机盐。
① 人、恒温动物肠道内微生物提供与人和动物之间
人、动物为微生物提供适宜温度及营养物质。微生物活动。为人、及动物提供了氨基酸、维生素等营养。
② 植物体表面也存在着许多正常的微生物区系
如：种子表面草生假单胞菌可以抑制，霉菌（青霉、曲霉）及酵母菌的生长。
二、共生关系：
两种生物共同居住在一起，彼此有利，创造相互有利的营养和生活条件，较单独生活时更有利，更有生命力。
如：
① 地衣：典型例子。是单细胞澡类或是细菌与真菌的共生体，藻类或兰细菌从真菌中获得水份、无机盐等养料，真菌从藻类或兰细菌中获得有机养料，二者相互依存，形成特定的共生体。
② 根瘤菌与豆科植物：根瘤菌从植物中获得有机物进行固氮，植物利用根瘤菌固定的氮素进行生长。
③ 细菌与原生动物：细菌栖息于原生动物细胞内，获得营养及保护，原生动物利用细菌的合成物质。
④ 微生物与反刍动物：微生物在反刍动物胃内，获得营养，及温度等环境条件，动物利用微生物分解纤维素产生的葡萄糖或纤维二糖，或有机酸等。
⑤ 微生物与昆虫：
A：外共生：微生物生活在动物细胞外面，动物肠道内及生活环境中，如：白蚁与肠道内微生物，白蚁不消化纤维素，靠微生物分解。
Ｂ：内共生：微生物在动物细胞内生活。许多昆虫细胞内含有微生物，对昆虫生活是必要的，它可以合成维生素等。
三、竞争关系：
二种微生物生活在一起，为争夺食物、空间等而发生的斗争。（使生长受抑制，适应强的微生物占优势，而排斥另一种微生物。）
如：将二种微生物在液体培养中做分别培养和混合培养，然后计数。结果：分别培养二种微生物个体数多，混合培养个体数少，说明二者混合培养为争夺食物空间而发生斗争。
四、拮抗关系：
一种微生物在生命活动中产生某种代谢产物或改变环境条件（温度、ＰＨ）而抑制或杀死一种微生物的现象。
（一）非特异性拮抗：无专一性
如：
① 酵母菌产生的乙酸（无氧条件下）可以抑制其他微生物。
② 乳酸菌、醋酸菌：发酵产生乳酸和醋酸，使ＰＨ下降，而抑制多种不耐酸的微生物生长。（腌酸菜）
（二）特异性拮抗：有专一性。
微生物生命活动中产生的代谢产物，只对某一种或某一类微生物有杀死或抑制作用。可选择性杀死或抑制其他种微生物生长。
如：微生物代谢产物——抗生素。
① 青霉素：可抑制Ｇ＋、部分Ｇ－菌生长。
② 制霉素：抑制酵母菌和霉菌生长。
③ 链霉素等抑制原核微生物生长。
五、寄生关系：
是一种生物生活在另一种生物体的体表或体内，从中摄取营 养物质而进行生长，繁殖，并在一定条件下杀死或伤害另一种生物。前者为寄生物，后者为宿主或寄主。
种类：专性寄生物：寄生物对寄主一般有害，寄生物离开寄主不能生活——专性寄生物。
兼性寄生物：寄生物离开寄主可以营腐生活不死亡。
如：
① 噬菌体与细菌和放线菌。
② 真菌和真菌间，细菌和细菌间。
食菌蛭弧菌能寄生在鼠伤害沙氏门菌，大肠杆菌。假单胞菌内。
盘菌菌丝寄生于毛霉菌丝中，木霉寄生于马铃薯丝核菌内。
③ 微生物与高等植物之间，引起植物传染性病害，导致减产。植物病毒：３５０种，其次真菌、细菌病害。
④ 微生物与人体或动物体的寄生关系：主要是人和动物的病原微生物。有许多细菌、真菌、病毒及病原菌都可寄生在人及动物体内、体表。
六猎食关系：
一种生物捕食另一种生物的现象。原生动物捕食细菌、真菌、藻类等。如：细菌，放线菌，单细胞藻类，真菌孢子是原生动物的食物，为猎食关系。
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