支原体菌种资源共性描述规范

                          1.1.1.2　前    言

      本规范由微生物菌种资源平台建设项目提出。

      本规范起草单位：中国农业科学院土壤肥料研究所、中国科学院微生物所、中国林业科学研究院森林保护研究所、中国药品生物制品检定所、中国医学科学院医药生物技术研究所、中国兽医药品监察所、中国食品发酵工业研究院。

      本规范主要起草人：叶强、姜瑞波、顾金刚、周宇光、朴春根、张月琴、陈敏、程池等。 

                          1.1.1.3　引    言

      支原体（Mycoplasma）是目前所能发现的能在无生命培养基中生长繁殖的最小的微生物。是一类无细胞壁的原核细胞型微生物，由于其能形成有分枝的长丝，故被称之为支原体。支原体能导致人类和动物、植物疾病。

      支原体菌种资源是微生物菌种资源的重要组成部分，与其他微生物菌种资源有着相似的共性描述内容，又具其特殊性。本规范根据当前国家自然科技资源平台建设的总体要求，结合支原体菌种资源的特点而制定，以实现支原体菌种资源描述信息的规范化，有利于支原体菌种资源的收集、保存、鉴定、评价、研究和利用，科学整理菌种资源，促进菌种资源信息化，实现菌种资源的高效共享和可持续利用。 

                  1.1.1.4　支原体菌种资源描述规范

 

1 范围

      本标准规定了支原体菌种资源的描述内容、描述要求。

      本标准适用于支原体菌种资源的收集、整理和保存及数据库和信息共享网络系统的建立。

 

2 规范性引用文件

      下列文件中的条款通过本规范的引用而成为本规范的条款。凡是注明日期的引用文件，其随后所有的修改单（不包括勘误的内容）或修订版均不适用于本规范，然而，鼓励根据本规范达成协议的各方研究是否可以使用这些文件的最新版本。凡是不注明日期的引用文件，其最新版本适用于本规范。

      GB 19489-2004 实验室 生物安全通用要求

      国务院令第424号发布《病原微生物实验室生物安全管理条例》

      科技部自然科技资源平台联合管理办公室文件《自然科技资源共性描述规范（试行）》

3 术语、定义、符号、缩写语

1.2　

      支原体 Mycoplasma

      是目前所能发现的能在无生命培养基中生长繁殖的最小的微生物。是一类无细胞壁的原核细胞型微生物。支原体属于软壁菌门（Tenericutes）、柔膜体纲（Mollicute）、支原体目(Mycoplasmatales)、支原体科（Mycoplasmataceae）、支原体属。现知有64个种。 对人致病的主要为肺炎支原体（M.pneumoniae）、人型支原体(M.hominis)和生殖器支原体（M.genitalium）。广义的支原体还包括支原体科脲原体属的解脲脲原体（Ureaplasma urealyticum）。

1.3　

      支原体菌种资源  Mycoplasma culture collections

      是指经妥善保藏管理的支原体菌种实物及其相关信息

4 要求

4.1 对菌株的描述条款应明确而无歧义，并且：

      描述内容应清楚、准确、力求完整；

      要充分考虑菌株的最新研究进展；

      能被微生物专业人员理解。

4.2 描述要素

      描述要素分为2类

      5   M：必备要素，必须描述的要素。

      6   O：可选要素，其描述与否视具体菌株而定。

7 描述内容

      对于支原体菌种资源的描述应从资源基本信息、生态环境、形态学特征、培养特征、生理生化特性、细胞化学组分、遗传学特性、功能特性等八个方面进行描述。数量性状描述以计量单位表示，质量性状描述符按评价规范和等级划分表示。

5.1 基本信息

5.1.1学名(M)

      支原体在微生物分类学上的学名。

5.1.2中文名称(M)

      支原体的中文名称。尚无中文译名时，可暂时空缺。

5.1.3资源归类编码(M)

      国家自然科技资源平台资源分级归类与编码标准中的编码。

5.1.4菌株保藏编号(M)

      支原体在保藏机构的保藏编号，由前缀和菌株编号两部分组成。前缀，即保藏机构名称的缩写，前缀和株菌编号之间不留空格。

5.1.5其它保藏机构编号(O)

      该支原体菌株在其他菌种保藏机构中的菌株保藏编号，有两个以上编号时，中间用分号隔开。

5.1.6生物安全等级(M)

      描述衣原体的生物安全等级归类：以生物安全一类、二类、三类、四类表示。

5.1.7编目收藏时间(O)

      保藏机构收集、按一定的规范编号建立菌种档案并保存该菌株的时间。以yyyy－mm－dd表示。

5.1.8 来源历史(M)

A.1　保藏单位得到该支原体菌株的途径，转移途径以左指向箭头连接。

5.1.9 提供者(O)

      支原体菌种资源提供人/单位的名称。

5.1.10 原始编号(O)

      支原体菌株的最初分离编号。

5.1.11分离源(O)

      该支原体菌株的分离源，宜指明具体的分离物质和部位。

5.1.12原产国或地区(O)

      支原体菌种采集地所在国家或地区名称。

5.1.13采集地区(O)

      分离采集地的行政区划，详细到县。

5.1.14采集地点(O)

      采集分离的具体地点。

5.1.15采集时间(O)

      原始样品的采集时间，用YYYY-MM-DD表示。

5.1.16培养基 (M)

      适合支原体生长的营养物质 (包括添加的血清) 的名称及统一编号。

5.1.17培养条件(M)

      指适宜支原体菌株生长的温度（以℃表示）、相对湿度、pH、厌氧和其它条件。

5.1.18 培养时间

      支原体在特定培养条件下，生长至成熟（稳定）所需要的时间，以h表示。

5.1.19模式菌株（M）

      凡是模式菌株应予指明。

5.1.20分类地位 (M)

      应指明每个菌株的界、门、纲、目、科、属、种。

      如需要，可指明该菌株的变种、亚种名称等。

5.2 特征特性信息

5.2.1形态学特征

      —— 细胞形状 (M）

        描述支原体显微镜下所观察到的形状，如球形、丝状、环状、星状、颗粒状和螺旋状等。

      —— 细胞大小（M）

        描述支原体细胞的大小，其大小其大小以直径表示，单位为µm。

      —— 荚膜(M)

        描述支原体是否有荚膜。

5.2.2  培养特性

      —— 培养条件（M）

        描述培养条件是否需要加入人或动物血清。

      —— 固体培养基上菌落大小 (M)

        描述支原体在固体培养基上的菌落大小，通常以直径表示，单位为 mm。

      —— 固体培养基上菌落形状（M）

        描述菌落是呈典型的呈荷包蛋样（中心稠厚，四周半透明，并常深入培养基内），还是呈颗粒状菌落。

      —— 液体培养基中的浑浊度(M)

        描述支原体在液体培养基中混浊度情况。

5.2.3  生化反应 （O）

      描述支原体能否利用葡萄糖；能否水解精氨酸；能否水解尿素；是否需要胆固醇；能否还原四氮唑；能否吸附红细胞。

5.2.4表面抗原分型

      描述抗原分型基础和所采用的方法及抗原分型结果。

5.2.5遗传信息

      支原体所含DNA和RNA的比值；支原体全部或部分基因序列；支原体基因组的碱基对数目，以kb表示。碱基链数目；碱基链存在方式 ；碱基链性质；开放阅读框的数目和位置； G+Cmol%。

      —— 核酸类型(M)

        描述衣原体遗传物质的核酸类型，DNA/RNA。

      —— 核酸序列 (0)

        描述衣原体全部或部分基因序列。

      —— 基因组大小(O)

        描述衣原体基因组的碱基对数目，以kb表示。

      —— 碱基链数目（M）

        描述衣原体碱基链的数目。

      —— 碱基链存在方式 (M)

        描述碱基链存在方式。

      —— 碱基链性质(O)

        描述碱基链的性质。

      —— 开放阅读框的数目和位置（O）

        描述衣原体开放阅读框的数目和位置。

      —— G+Cmol% 

        描述衣原体G+Cmol% 含量。   

5.2.6  生物学特性

      —— 自然宿主  

      —— 感染致病性或毒性

        描述衣原体的感染性或毒性。

      —— 胞外稳定性

        描述支原体胞外是否稳定。

      —— 流行季节(O)

        支原体所致疾病与季节的关系。

      —— 传播方式(M)

        描述包括经飞沫、呼吸道传播和直接（性）或间接接触传播等传播方式。

      —— 地理分布(O)

        描述支原体所致疾病的地理分布。

      —— 组织嗜性(M)

        描述支原体的主要易感细胞和主要易感部位。

      —— 对宿主致病的病理变化（O）

        描述支原体对宿主致病的病理变化情况。

      —— 对热的抵抗力(0)

        描述支原体对温度的耐受程度

      —— 消毒剂的敏感性（O）

        描述支原体对消毒剂敏感的种类与敏感程度。

      —— 对抗生素的敏感性(O)

        描述支原体对抗生物敏感的种类与敏感程度。

5.2.7功能特性(0)

      描述支原体菌种的主要用途。包括分类学、分析检测、经济用途、环保、医学、研究、教学等。

5.2 其它信息

5.2.1保藏方法(M)

      保存支原体菌种资源采用的技术方法。包括液氮超低温冻结、-80℃冰箱冻结、真空冷冻干燥、矿物油斜面、斜面等。

5.2.2显微图片(M)

      支原体的显微图片。

5.2.3参考文献(O)

     与支原体菌种资源相关的资料信息，包括书籍、期刊、学术报告及其他。

 

参考文献

 

参考文献

[1] 陆德源等.医学微生物学第五版. 北京：人民卫生出版社，2001

[2] 周德庆.微生物学教程. 北京：高等教育出版社，1993

[3] M.T.马迪根，J.M.马丁克，J.帕克.微生物生物学.杨文博等译. 北京：科学出版社，2001

[4] M.J.小佩尔扎等.微生物学.武汉大学微生物学教研室译.北京：科学出版社，1987

[5]武汉大学、复旦大学生物系微生物学教研室. 微生物学.人民教育出版社，1979

[6]中国科学院微生物研究所.菌种保藏手册.北京：中国轻工业出版社，1980

[7]中国标准出版社第一编辑室.标准化工作导则、指南和编写规则标准汇编.北京：中国标准出版社，2003

[8] 杨苏声.细菌分类学.北京：中国农业大学出版社，1997

 

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