2.6 细菌鉴定：
在痰标本的直接涂片镜检结果的指导下进行分离鉴定：根据痰液涂片直接镜检结果中被炎性包裹及脓细胞吞噬的细菌的革兰染色后的形态特征为指引，阅读平皿中菌落形态并作菌落细菌的革兰染色，选择与镜检结果一致的细菌（该步骤应该在经验丰富的高资历微生物检验老师的带领下进行），必要时进行纯培养，再根据该细菌在各种不同培养基上的生长情况及相应菌落特征进行初步鉴定和分群，随后在细菌革兰氏染色镜检特点、触酶、氧化酶等简单试验的进一步鉴定和分群到相关的科或属后采用相应的编码鉴定系统鉴定手工或自动化鉴定，对溶血性链球菌及肺炎链球菌在生化反应的同时采用乳胶试剂作为补充。为了缩短鉴定时间还可采用具有培养鉴定一体化作用的多功能培养基[14、16]配合快速酶法编码鉴定系统进行鉴定。
2.7 药敏试验：
按CLSI相关规定[18~19]进行药敏试验。尚可采用特殊的药敏试验观察计算方法（如自动化仪器采用的光电浊度速率法、荧光速率法等）缩短药敏时间。也可按文献提供的方法，及时向临床提供一份快速的初步报告。
2.8 结果报告：
常规痰培养报告应包括完整的病人信息、临床诊断、抗生素使用情况（由临床医生在申请单上注明）、未染色标本直接涂片结果（有无脓细胞、脓细胞数量、上皮细胞数量、二者比例、有无真菌孢子／菌丝、有无寄生虫等）、Gram染色镜检结果（包括脓细胞数量、上皮细胞与胞外正常菌群数量与污染程度、脓细胞胞内吞噬细菌／真菌孢子的情况，炎性包裹物内细菌和真菌的存在情况、脓细胞和炎性包裹物内的细菌／真菌的染色特征、形态特征和排列特征）、所分离细菌的鉴定结果、耐药监测结果、一般药敏结果、该检验结果与临床诊断和治疗相关性的评述和建议。
2.9 质量控制：
为保证细菌学检验结果的快速准确和临床符合率，应对全过程进行严格的质量控制。痰标本细菌学检验质量控制包括二大部分：
2.9.1 标本的质量控制：主要包括向临床医护人员讲授痰标本的正确性的采集方法、送检时限和注意事项，不定时的到临床调查标准化采集的执行情况，定期反馈统计信息；坚持对所送标本进行外观和镜下的初筛；坚持标本的直接涂片镜检（包括不染色标本的高倍/低倍镜湿片镜检、10%KOH透明后镜检、革兰染色后的油镜镜检）。
2.9.2 检验过程的质量控制，这部分又包括了以下方面和步骤：
2.9.2.1 培养基质量控制：主要是各种首代分离培养基的效果控制：包括不同培养基配制过程的标准化、质控菌株生长情况控制（应包括GI指数测定、菌落特征典型程度、而选择性培养基还应监控抑菌选择效果、菌落显色培养基还应观察菌落显色是否灵敏和鲜明），以及培养基从临床标本中分离出目的菌能力的测定。
2.9.2.2 鉴定水平质量控制：主要是采用典型质控菌株对生化反应培养基、鉴定卡和微量生化管等试剂进行定期测试：测试项目：典型阴阳性反应、灵敏度、鉴定符合率和重复性。另外还应对技术人员的技术水平的进行不间断的再培训和不定期测试。
2.9.2.3 药敏试验质量控制：包括对MH培养基、药敏纸片或MIC卡的质量控制，方法参照CLSI相关规定。对于MRS、ESBL、HLAR、AMPC、金属β-内酰胺酶等特殊耐药表型应坚持在18小时观察后继续培养至24小时或48小时（MRS）后复查一次。另外，在药敏试验的同时还应用接种环挑取一环菌液作划线接种，可对所配菌液进行纯培养的验证，并可同时监控菌液浓度。
2.9.2.4 采用全程质控观点对标本进行控制：采用标本直接涂片镜检结果推断病原菌，指导分离鉴定方向；采用细菌培养特征（营养要求高低、不同选择选择性培养基生长情况及菌落特征）指导鉴定及对鉴定结果进行核查；采用鉴定结果对药敏结果进行控制或采用药敏的特殊谱型对鉴定结果进行控制（即利用已知菌对某种药物的天然耐药或天然敏感特征）[21-22]；采用对临床病历的抽样调查观察临床治疗效果，借以反馈检验结果与临床的符合率。
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