一. 目的
掌握RT-PCR技术的一般原理和操作步骤
二.原理
PCR(聚合酶链式反应)技术是利用从嗜热水生菌(Thermasaquaticus)中提取或经基因重组合成的耐热DNA聚合酶(常用TaqDNAPolymerase)在高温下快速扩增位于两段已知序列之间DNA片段的技术。PCR过程包括:一.DNA模板的变性(94-95℃),二.单链DNA模板与引物的退火(45-55℃),三.引物的延伸(72℃),这三步经25-30个循环而完成了PCR的全过程 。
三.材料、试剂及仪器
病毒侵染的植株和健康对照总RNA或病毒RNA,3 ’特异性引物1,5’特异性引物2 ,AMV 反转录酶,5X 反转录buffer ,10mMdNTP,TaqDNAPoiymerase ,10 ×TaqDNAPoiymeraseBuffer(内含50mM/LKCL 、10mM/LTris.Cl(pH8.3)、1.5mM/LMgCL),ddH2O。
液体石蜡,小离心管,移液器,PCR扩增仪。
四.步骤
1.反转录(RT )
反应体系:
ddH2O μl
5X反转录Buffer 10μl
10mMdNTP 3 μl
RNasin 40u
模板RNA 0.1-1 μg
3’端特异引物 0.1 μg
AMV反转录酶 10
总体积 50 μl
反应条件:42℃ 1-2小时。
2.PCR扩增
反应体系:
ddH2O μl
10×PCRbuffer 10μl
10mMdNTP 0.5 μl
5’引物(0.1ug/ μl) 1μl
3’引物(0.1ug/ μl) 1μl
TaqDNAPolymerase 2-5u
模板反转录产物 1-5μl
总体积 50 μl
石蜡油 70 μl
反应步骤:
循环变性退火聚合
1 94℃ 5分钟 55℃ 1分钟 72℃ 2分钟
2 94℃ 1分钟 55℃ 1分钟 72℃ 2分钟
末轮循环 94℃ 1分钟 55℃ 1分钟 72℃ 7分钟
3. 电泳检测与分析
PCR反应完毕,取6-8 μl反应产物于0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,选择合适的DNA 分子量标准作对照。
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