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原核微生物伯杰氏分类系统



录入时间:2011-11-24 9:50:37 来源:《微生物学》

 细菌、放线菌等原核微生物的分类系统很多,目前较有代表性和最有影响的分类系统是美国的《伯杰氏细菌学鉴定手册》 (Bergey , s Manual of Determinative Bacteriology ,以下简称“手册” ) 。“手册”自 1923 年第一版以采,相继于 1925 1930 1934 1939 1948 1957 年出版了第二版至第七版,几乎每一版均吸取了许多分类学家的经验,其内容经过不断地扩充和修改。“手册”第七版包括从纲到种、亚种的全面分类大纲和相应的检索表以及各分类单位的描述,将细菌列于植物界原生植物门的第二纲——裂殖菌纲。“手册”第七版的分类方法基本上处于经典分类法阶段,即以形态特征为主结合生理生化特性为分类依据。第八版 (1974 ) 没有从纲到种的分类系统,而着重于属、种的描述和比较,它也没有分类大纲,而是根据形态、营养型等分成 19 个部分,把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体、枝原体和立克次氏体等 2 000 多种微生物归于原核生物界细菌门。手册第八版的分类方法也有了改进,除采用经典分类法外,还增加了细胞化学、遗传学和分子生物学等方面的新鉴定方法,对某些属、种应用了数值分类法。

 

1994 年,《伯杰氏细菌学鉴定手册》第九版出版。该手册根据表型特征把细菌分为四个类别, 35 群。“手册''第九版与过去的版本相比较,具有以下特点:① 该书的目的只是为了鉴别那些已被描述和培养的细菌,并不把系统分类和鉴定信息结合起来;② 其内容的编排严格按照表型特征,所选择的排列是实用的,为了有利于细菌的鉴定,并不试图提供一个自然分类系统;③ 手册抽取了《伯杰氏系统细菌学手册》四卷的表型信息,并包括了尽可能多的新的分类单元,其有效发表的截止日期是 1991 1 月。

 

1984 1989 年间,“手册”的出版者出版了《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey , s Manual of Systematic Bacteriology ,简称“系统分类学手册” ) 。该手册与《伯杰氏细菌学鉴定手册》有很大不同,首先是在各级分类单元中广泛采用细胞化学分析、数值分类方法和核酸技术,尤其是 16S rRNA 寡核苷酸序列分析技术,以阐明细菌的亲缘关系,并对第八版手册的分类作了必要的调整。例如,“系统细菌学手册”根据细胞化学、比较细胞学和 16S rRNA 寡核苷酸序列分析的研究结果,将原核生物界分为四个门。由于这个手册的内容包括了较多的细菌系统分类资料,定名《伯杰氏系统细菌学手册》,反映了细菌分类从人为的分类体系向自然的分类体系所发生的变化。为使发表的材料及时反映新进展,并考虑使用者的方便,该手册分四卷出版。第一卷 (1984 ) 内容为一般、医学或工业的革兰氏阴性细菌。第二卷 (1986 ) 为放线菌以外的革兰氏阳性细菌。第三卷 (1989 ) 为古细菌和其他的革兰氏阴性细菌。第四卷 (1989 ) 为放线菌。 2000 年, Bergey , s Manual of Systematic Bacteriology 第二版编辑完成并分成 5 卷陆续出版。在此第二版中,细菌域分为 16 门, 26 组, 27 纲, 62 目, 163 科, 814 属,收集了 4 727 个种。古菌域分为 2 门, 5 组, 8 纲, 11 目, 17 科, 63 属,收集了 208 个种。供收集进原核微生物 4 935 个种。

 

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