针对真菌的共同序列而设计的‘全能引物’（pan-primer）而扩增580bp的产物，为真菌所共有。检测血液标本即可明确体内有无真菌感染。
（二）用于真菌的型别分析。国内应用随机引物PCR扩增后进行真菌分型，结果可靠。应用随机引物扩增物多态性分析（RAPD）可以将5种曲霉菌鉴别开（烟、黄、黑、土、构巢曲霉）。国外结合PCR与酶标记探针在纸条上进行检测（LiPA,lineprobeassay）可鉴别出主要的致病性真菌。
（三）检出念珠菌的基因变异快速确定念珠菌对酮康唑的耐药性。此种耐药性由基因的1554T突变为C而致，应用Lightcycler仪器，以荧光共振能量转移和基因片段溶解温度曲线技术测定。
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