在人体的皮肤、黏膜和肠道上，有大量的微生物，它们的数量非常庞大。虽然一部分微生物具有致病性，但绝大多数是无害甚至有益的。这些微生物被称为微生物群落。它们就像器官一样行使实质性功能。很多食物单凭自身是不能消化吸收的，一些微生物会合成维生素和其它必需的元素来帮助消化吸收。此外，微生物群落还可以分解药物和毒素。调节先天性和获得性免疫，保护宿主避免感染和免疫紊乱。
关于人体微生物与疾病的研究，大部分集中在肠道。因为肠道中的微生物占人体微生物的绝大多数，一旦失调，就会产生一系列疾病。人与人之间的生物群落没有完全一致的，但大致上相似。尽管细菌种属不同，但它们的基因功能是相同的。
人体从一出生开始就有微生物寄生，在慢慢成长的过程中形成性对稳定的微生物菌落平衡。肠道微生物菌落与宿主健康状况的关系十分密切。大多数情况下，微生物菌落与疾病维持着一个简单的关联，但目前还不清楚微生物群的变化是否会精确地引起疾病或者只是简单地反映某种疾病的状态。进一步说，还不清楚微生物平衡是如何或者为什么会朝着菌群失调这种非健康的方向变化。目前的研究认为有三个因素可能会对人体肠道微生物群落产生影响：1、抗菌药的使用。抗菌药物的使用有可能大量杀死某一类型的微生物，从未破坏人体微生物群落。2、饮食。人们的日常饮食会影响人体内微生物的组成，而且食物中的一些化学制剂或者与某些化学制剂具有类似功能的成分都有可能影响体内的微生物菌落。3、心理压力。心理压力也会改变人体内的微生物群落状况，可能引起一些微生物的增加，同时也会降低某些微生物的数量。
人体肠道微生物菌落异常与自身免疫疾病、肥胖、糖尿病、自闭症神经系统疾病等很多疾病或健康问题相关。自身免疫疾病是一类非常特殊的疾病，目前没有非常有效的治疗手段。武汉中帜生物科技有限公司开发出了5种针对自身免疫疾病的诊断试剂，包括使用抗核抗体谱-16测定试剂盒（斑点免疫法）、抗核抗体筛查试剂盒（酶联免疫法）、抗双链DNA抗体测定试剂盒（酶联免疫法）、抗SSA抗体测定试剂盒（酶联免疫法）以及抗SmD1抗体测定试剂盒（酶联免疫法）。中帜生物的自身免疫诊断试剂产品具有更简单、更可靠、更全面的优点。特别是抗核抗体谱-16测定试剂盒首次在同类产品中使用斑点免疫法，可以同时检测16种常见自身免疫性疾病抗核抗体。在产品的印迹膜上预染坐标点，辅助快速识别抗原点；独特的双重检测点使结果更准确可靠；产品拥有专利，由美国技术开发，高效可靠。同时，武汉中帜生物科技研发的研发人员正在开发多种基于PCR技术检测病原体的产品，在短期内可以与用户见面。这些产品将会帮助医生更加快速、准确的判断患者体内致病性病原体的种类，将会大大提高用药针对性，有助于患者快速康复。
既然人体微生物确实与很多疾病相关，很多研究者也希望开发出一些新的治疗方案来解决这些疾病。一些实验员已经尝试使用益生菌和益生素来治疗人体微生物群落相关的疾病。随着基因组测序等技术的发展，研究人员可以更方便地获得更多有关微生物群落的信息，包括微生物菌落的基因组等。这些技术大大推动了人体微生物群落领域的发展，但仍然还有很多问题亟待人们去解决。
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