生物修复（bioremediation）：利用生物将土壤、地表及地下水或海洋中的危险性污染物现场去除或降解的工程技术系统。
生物修复与生物处理是一致的，两者的区别在于生物修复几乎专指已被污染的土壤、地下水和海洋中有毒有害污染物的原位生物处理，旨在这些地方恢复“清洁”，而生物处理一般具有更广泛的涵义。
可用作生物修复的微生物类型：1）土著微生物；2）外来微生物；3）基因工程菌。
3.4.1土壤生物修复的原位处理方式
这种方法是在受污染地区直接采用生物修复技术，不需要将土壤挖出和运输。其基本方法是在修复区钻井，一组是注水井，用来将接种的微生物、水、营养物和电子受体等物质注入土壤中；另一组是抽水井，通过抽取地下水，造成地下水在地层中流动，促进微生物的分布及营养物质的运输。
例：生物通风系统
有机污染物会降低土壤中的氧气浓度，增加二氧化碳浓度，进而抑制污染物进一步生物降解的条件。因此，生物通风系统向土壤中补充氧气来提高土壤中的污染物降解效果。
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