麦康凯平板上小肠结肠炎耶尔森氏菌
大多数常用的肠道平板培养基都可以用于小肠结肠炎耶尔森氏菌的分离。在SS上于25℃经24 h培养，菌落细小，至48 h直径才增大至0.5～3.0 mm。菌落圆整、光滑、湿润、扁平或稍隆起，透明或半透明；在麦康凯琼脂上菌落扁平、无色或者淡红色，淡黄色，如若微带红色，则菌落中心的红色常稍深。菌落直径1～2 mm。
DHL平板上的小肠结肠炎耶尔森氏菌
在DHL琼脂上菌落红色，菌落中心的红色更深，直径1～2 mm。
SSK平板上的小肠结肠炎耶尔森氏菌
在SSK琼脂上菌落深粉红色，半透明，直径2 mm
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