截止到2013年7月，根据国家质量监督检验检疫总局发布的统计数据，国内获取食品检验机构资质认定(CMAF)的检测机构总计3500-3900家(质检总局公布的数据是3503家，认监委肖亮在第五届中国第三方检测实验室发展论坛暨实验室展览会公布的数据是3827家)，其中国家级获证机构410家。
图1 各省获证食品检测机构分布图
图2 食品检测机构系统系统分布百分比
2013年，全国疾控中心总计3522家，其中具有CMAF资质认证的中心数量为1625家，约占整体数量的46.14%。虽然从数据上看，具有CMAF认证的疾控中心在整个疾控体系中比例较高，但是目前的疾控中心基本是有原来的防疫站更名成立的，尤其是地市级和县级的疾控中心更是如此，并且这类拥有CMAF资质疾控中心大部分从事食源性疾病的检测，食品和农产品的质量安全检测能力薄弱。
由于大部制改革还在逐步整合，目前食品药品及技监系统均有从事食品检测的检测机构。根据国家产品质量技术监督管理总局公布的数据，技监系统和食品药品系统的获证食品检测机构总计1299家，具体省份分布请见下表：
表1 1299家技监、食品药品系统食品检测机构分布情况
民营的食品检测机构数量为116家，主要集中在上海、浙江、广东、山东等沿海城市。
表2 116家民营食品检测机构分布情况
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