过滤灭菌法是利用细菌不能通过致密具孔滤材的原理以除去液体或气体中微生物的方法。主要用于血清、毒素、抗生素等不耐热生物制品及空气的除菌。除菌过滤器采用孔径分布均匀的微孔滤膜作为过滤材料，微孔滤膜分为亲水性和疏水性两种。滤膜材质依过滤物品的性质及过滤目的而定。滤膜孔径一般有0.45μm和0.22μm两种，药品生产中采用的除菌滤膜孔径一般不超过0.22μm。过滤器不得对被滤过成分有吸附作用，也不能释放物质，不得有纤维脱落，禁用含石棉的过滤器。
如果要过滤的溶液的量比较大，超过500ml，可以采用已灭菌的抽滤瓶，预先垫好0.22um的滤膜。抽滤瓶灭菌前要检查封口用纱布或棉花堵牢；如果量小，用注射器加滤器、0.22微米滤膜过滤，滤膜用去离子水浸湿，贴合滤器出水口放置，防止漏液，加上滤膜后拧上盖子，不要拧太紧，稍旋松，用报纸包裹，121℃高温高压灭菌15min。用来承接滤液的瓶也需121℃高温高压灭菌15min。用时在无菌操作台上操作，并先旋紧滤器，注意滤器外流下去的哪怕一滴也会造成染菌；过滤应该是费力的，如果感觉很轻松，则滤膜已破。0.45 um的滤膜一般用于两次过滤的第一层滤膜，以防止0.22um滤膜堵塞。
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