The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，两项中国学者的测序成果格外引人注目。生物通 www.ebiotrade.com
种属：丝叶狸藻（Utricularia gibba）
基因组：82 million bp生物通 www.ebiotrade.com
Buffalo大学、Barcelona大学等机构的研究人员测序了丝叶狸藻的基因组序列，并将结果发表在一月份的Molecular Biology and Evolution杂志上。
丝叶狸藻的基因组包含28,500个编码基因与挪威云杉差不多，不过云杉基因组比丝叶狸藻大250倍。研究人员发现，丝叶狸藻经历过三次基因组加倍，应该是通过大规模DNA删除形成这么紧凑的基因组。在许多生物中，不少基因属于同一个家族（按功能划分）。但丝叶狸藻的基因大多是“单独”的，一个基因负责一个特定的功能。生物通 www.ebiotrade.com
“丝叶狸藻经历了如此大的DNA删除，留下的基因一定有相当高的优势，”文章的共同作者Victor Albert说。
研究显示，丝叶狸藻拥有一些适应水中环境的独特基因，这些基因涉及了细胞壁的生物合成，以及叶和根的发育调控。研究人员还鉴定了赋予丝叶狸藻食肉能力的基因，这些基因编码着可消化肉类的酶，有些甚至类似于人类的胃蛋白酶。（原文：High gene family turnover rates and gene space adaptation in the compact genome of the carnivorous plant Utricularia gibba）生物通 www.ebiotrade.com
种属：钩虫（Ancylostoma ceylanicum）
基因组：313 million bp生物通 www.ebiotrade.com
据统计，全世界有四亿人受到钩虫的困扰。康奈尔大学、麻省大学、加州大学和加州理工的研究人员测序了钩虫Ancylostoma ceylanicum的基因组，并将结果发表在三月二日的Nature Genetics杂志上。A. ceylanicum基因组包含约两万七千个蛋白编码基因，另外还有一万个基因编码与寄生有关的短肽。研究显示，至少有一个基因来自于细菌水平基因转移。
A. ceylanicum既能感染人也能感染其他动物。研究人员在仓鼠中研究了钩虫致病的不同阶段，通过基因表达数据鉴定了约九百个在感染初期上调的基因，这些基因编码蛋白酶、核酸酶以及多种分泌蛋白。研究人员还确定了13个疫苗和药物开发的潜在靶标。生物通 www.ebiotrade.com
除了有助于预防或治疗钩虫感染，A. ceylanicum基因组还可以帮助人们理解钩虫对免疫系统的抑制，以及为何这种寄生虫与近亲线虫相比体形更大寿命更长。（原文：The genome and transcriptome of the zoonotic hookworm Ancylostoma ceylanicum identify infection-specific gene families）
种属：西藏青蛙（Nanorana parkeri）生物通 www.ebiotrade.com
基因组：2.3 billion bp
中科院昆明动物所、云南大学、华大基因的研究人员日前完成了首个现代蛙类基因组测序。高山倭蛙（Nanorana parkeri）的基因组含有23,400个蛋白编码基因，具有大量的长末端重复序列(LTR)。该基因组序列可以为人们提供高山倭蛙适应西藏极端环境（高海拔、温差大、紫外线强、氧气稀薄）的宝贵线索。生物通 www.ebiotrade.com
与之前测序的非洲爪蟾相比，这个雌性高山倭蛙的基因组多了800 million bp。这一差异主要来自于占高山倭蛙基因组48%的转座元件。高山倭蛙基因组含有970 million bp转座元件，其中大部分是长末端重复序列LTR，这与富含转座子的非洲爪蟾不同。（延伸阅读：达尔文诞辰Nature发表重要测序成果）
研究人员发现，高山倭蛙和非洲爪蟾的分歧时间大约在2.66亿年前，与之前的爬行动物基因组研究相符。这么长的进化史说明青蛙的进化速度比其他脊椎动物（比如鸟类和哺乳类）慢得多。生物通 www.ebiotrade.com
研究人员还发现了217个在青蛙中高度保守的基因，其中一些涉及了舌头的发育，有助于理解这种动物快速伸长舌头捕捉苍蝇的能力。（原文：Whole-genome sequence of the Tibetan frog Nanorana parkeri and the comparative evolution of tetrapod genomes）
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