人类之所以对深海极端环境下的微生物有如此巨大的研究兴趣，除了其在探究生命起源、进化和外星生命是否存在方面有重要意义外，从更现实的角度上看，破解极端微生物生理生化特性及其产生的原因，从而开发特殊的基因与产物，可为工业、农业、环境、能源、人类健康的发展提供新的方向，为现代生物技术带来革命性进步。
例如，极端微生物的酶和代谢产物已成为生物技术创新的源泉之一，并已经创造了财富。1969年从美国黄石国家森林公园火山温泉中分离的嗜热菌产生的TaqDNA聚合酶，使DNA的体外复制变得异常简便，大大加快了生物工程、基因重组等分子生物学研究的进程，年销售利润达到上亿美元。在石油开采和湿法冶金领域，极端微生物可以发挥巨大作用。一般石油开采的采出率只有30%~40%，将具有分解石蜡能力的嗜热、耐压、嗜盐、厌氧菌的培养物与水，或菌剂与营养物及水一同注入油井中，可使石油采出率增加50%。在环境保护方面，工业废水一般是酸性、碱性或含盐量大，只有合适的极端微生物才能够分解其中可能造成环境污染的物质，净化水质。
极端微生物能够适应环境的多样性，说明它们早已解决了科学家今天仍在寻找答案的那些问题，对它们的研究开发，将为缓解资源、环境压力，保障社会可持续发展提供有效途径，因此深海极端微生物成为当今科学家关注和研究的重点。随着生物学及其他科学和技术的不断进步，将为深海极端微生物的研究提供更好的条件，会进一步促进深海极端微生物的研究和发展。
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