市面上的灭菌仪器品类众多，不同厂家的不同程序，会导致即使设定相同的灭菌时间和温度，也会导致整体的灭菌时长不同，这会影响最终的灭菌效果。同时，如果单次灭菌批量较大，单瓶体积较多，则也会使得灭菌效果出现波动。当灭菌锅装的培养基较多，容量较满时，部分厂家的灭菌锅升温时自动排气不能完全排出冷空气，最终会导致灭菌锅内温无法达到数显的数值。大批量灭菌时，建议同时使用生物指示剂来判断灭菌的效果。