霉菌酵母培养的时候发生霉菌污染通常是由于成熟的霉菌孢子因某些原因在培养皿内扩散，甚至扩散到培养箱内或其他区域造成的。控制方法主要有以下几点：在进行培养之前要确保上盖无冷凝水，可以在平板凝固的过程中放入超净工作台通风吹干；平板在培养箱中的摆放要符合标准要求，例如堆叠不要超过6个，不要排列得过于紧密等；如果担心培养箱内交叉污染，可以将平板放入封口袋中不封口培养；标准要求从培养的第三天开始进行观察，因此在观察的时候要水平移动，切勿翻转平板；