必须明确，无论那种分类方式，不同营养类型之间的界限并非绝对的，异养型微生物并非不能利用 CO₂ ，只是不能以 CO₂ 为唯一或主要碳源进行生长，而且在有机物存在的情况下也可将 CO₂ 同化为细胞物质。同样，自养型微生物也并非不能利用有机物进行生长。另外，有些微生物在不同生长条件下生长时，其营养类型也会发生改变，例如紫色非硫细菌在没有有机物时可以同化 CO₂ ，为自养型微生物，而当有机物存在时，它又可以利用有机物进行生长，此时它为异养型微生物。再如紫色非硫细菌在光照和厌氧条件下可利用光能生长，为光能营养型微生物，而在黑暗与好氧条件下，依靠有机物氧化产生的化学能生长，则为化能营养型微生物。微生物类型的可变性无疑有利于提高微生物对环境条件的适应能力。