该法主要原理就是高分子物质以溶质形式存在于两相溶剂中，根据其分配系数的不同而选择性地分配于其中的一方，从而达到纯化的目的。所采用的溶剂主要有：葡聚糖硫酸盐(Dextran]Sulphate，DS)和聚乙二醇(PEG)或甲基纤维素(MC)和聚乙烯醇(PVA)，形成DsPEG系、DsPVA系和DsMC系。利用病毒在有机溶剂中的分配原理，在适当的溶剂系统和葡聚糖层之间进行多次反复转换，不仅能够浓缩病毒，而且还可以纯化病毒。 通常是将两相溶剂如DsPEG以适当的重量百分比混合，然后加入病毒液，数次激烈振荡混合，置于4℃]24～36小时，即可分离为两层，病毒将特异地分布于其中一方(如Ds层]中)。适当改变溶剂的混合比例时，分配于Ds层中的病毒可由Ds层转入PEG中，而得以浓缩]。若调节适当，一步就可浓缩100倍，两步浓缩就可以达到10]000倍。非病毒物质通常以]不同的方式进行分配，从而达到浓缩纯化的目的。Nammar(1991年)应用DsPVA系纯化了反转录病毒。两相溶剂间分配系数法简单、温和，并能使病毒得到较高的浓缩和纯化。但是为了获得高度纯化的病毒，还需配合应用其它方法。
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