所有卤素均有显著杀菌力，其杀菌力的顺序为F < Cl < Br > I。

1.氟

氢氟酸比盐酸具有更强的杀菌力。对真菌及炭疽杆菌芽孢的杀灭作用显著，在实验室中有时用于预防培养基中霉菌的生长。

2 ．溴

纯品在相当高的稀释后，仍然是活泼的杀菌剂，有时用于游泳池的消毒。

3.碘

碘在水中的溶解度很小而且有挥发性，但与碘化钾结合后，便形成可溶性为KI₃。所以在制备碘溶液时要加入较大量的碘化钾，既可增加碘的溶解度，又能减低其挥发性。此溶液可用作皮肤消毒剂；碘甘油溶液可用于粘膜的消毒碘也可用于饮水的消毒，0.2 ppm 的碘，作用60 分钟可以杀死水中95-97％大肠杆菌；2-5 ppm则作用更强。1%碘酒10 分钟内可杀死细菌芽孢和一般真菌，使流感病毒灭活。炭疽杆菌芽孢对碘的敏感度反要比其繁殖体高2 - 8 倍。故杀灭炭疽杆菌芽孢最好使用碘榕浓。碘溶液不宜与红汞同时使用。

4.氯

通常以溶液状态加入水中，一般常用0.2 ～0.5ppm，作饮水或游泳池水消毒。有机物的存在能显著降低氯的作用。

氯的杀菌作用主要是能抑制各种带-SH 基的酶类或其他对氧化作用敏感的酶类。醛缩合酶对氯特别敏感。

次亚氯酸是较有效的杀菌剂，可用于公共饮食用具的消毒。含氯的50ppm可以杀死一般细菌；200 ppm在75 ℃ 左右作用2 分钟效果良好。

次亚氯酸的钙盐通称漂白粉。漂白粉是由一些成分复杂的化合物以不同的比例组成的。漂白粉有嗜水性，能由空气中吸水而变成盐，消失其所含氯气，所以要密封保存。其0.5-1%水溶液于5 分钟内可杀死大多数细菌；5%的水溶液于1 小时内可杀死细菌芽孢；0.2%漂白粉精溶液喷雾5 分钟能将空气中的流感病毒全部杀死，并可维持其消毒作用半小时。

含氯有机化合物，如氯能与酰胺类，有机化合物作用而生成氯胺类。常用的氯胺和双氯胺由于有-NCl基而有强大杀菌能力。它们与细菌蛋白质相遇后，将氯缓缓放出。杀菌效力较次亚氯酸持久，而且不受有机物的影响。0.5%氯按1 分钟可杀死大肠杆菌，30分钟可杀死金黄色葡萄球菌，10%溶液2 小时可杀死炭疽杆菌芽孢；3%溶液可用于消毒空气和其他一般物品。