耶尔森氏菌属属于好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌下的肠杆菌科。

直杆菌到球杆菌，直径0.5~0.8μm,长1~3μm。无芽孢。不形成荚膜，但在 37°C生长或来自体内样品的细胞中的鼠疫耶尔森氏菌(Y.pestis)能产生包被。革兰氏阴性。37°C时不运动。生长在30°C以下时以周生鞭毛运动。鼠疫耶尔森氏菌总是不运动。在普通的营养培养基上生长。在营养琼脂上培养24h后，菌落半透明到不透明，直径0.1~1.0mm。最适生长温度28~29°C。兼性厌氧，既具有呼吸型代谢又具有发酵型代谢。氧化酶阴性，接触酶阳性。除了个别的生物变型(biovars)外，都能还原硝酸盐成亚硝酸盐。发酵葡萄糖和其他碳水化合物产酸，但不产气或产少量的气。表现特征常常与温度有关，一般培养在25~29°C比在37~39°C能呈现出更多的特征性。所研究过的种具有肠杆菌的常见抗原。生境很广泛（从有生命到无生命），有些种适应于特异性寄主。DNA的G+Cmol%为46-50(Tm, Bd)。种间鉴别见表3-18。

模式种：鼠疫耶尔森氏菌(Yersiniapestis)。