在观察实验结果时，菌落形态也是重要的指标之一。当菌体在平板上生长时，有哪些因素会影响其形成菌落大小呢？

1.凝胶强度

  凝胶强度会影响菌落大小，作为凝固剂的琼脂由于生产批次、厂家之间存在差异，其凝胶强度也会有所不同。因此当自己使用原料配制培养基时，即使每次添加琼脂量相同，也可能会出现凝胶强度的差异。在商品化干粉培养基配制时，生产厂家会保证凝胶强度的稳定性，因此相较于使用原料自己配制培养基，更推荐直接购买商品化干粉培养基。

2.营养成分

  由于培养基常用的各种氮源、碳源往往是各种复杂的有机物，实际在原料批次之间亦有营养成分的差距，因此当自己配制培养基时，很可能会出现因为原料批次间差异导致的菌落大小或其他生长表现出现差异。

3.pH值差异

  细菌往往有自己的最适生长pH，因此当pH不在标准要求的范围内，或批次间差距较大时，也会导致菌落大小出现差异。因此当自己配制培养基时，若不进行pH值监测和调整，往往也容易导致最终培养的菌落大小批次间存在差异。

4.菌体自身影响

  菌体也会随着时间而老化，出现变异或活力下降的情况，当接种活性较差的菌株时，往往同样的培养时间内，其菌落会比活力好的菌落要小。随着工作菌株保存时间变长，部分菌属的细菌会形成芽孢，在培养时，由于菌体和芽孢复苏生长能力不同，可能会在培养基上出现大小不同的菌落，这并不一定是污染，小的菌落往往是芽孢繁殖体形成的。

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