革兰氏阴性兼性厌氧杆菌或球杆菌，大小为1～3.5×0.5～1.3 mm。大多以单个散在的形式分布，偶尔成短链状或堆状。

形态结构

小肠结肠炎耶尔森氏菌幼龄培养物可表现为球杆状。不形成芽胞，无荚膜，有周身鞭毛；但鞭毛只有在30℃以下的条件培养时才可形成，温度较高时即丧失，因此在30℃以下有动力，而35℃以上则无动力。 

培养特性

兼性厌氧，营养要求不高，4～40℃均能生长，生长最适温度20～28℃ 。但在4 ℃也能生长，将此菌培养24 h后，可形成扁平、半透明的小菌落。

本菌在22～29℃才能使某些特性出现。4℃时能保存和繁殖。许多肠道细菌在这个温度下则不能生长。本菌繁殖所需要的时间较长。在肉汤中生长呈均匀混浊，一般不形成菌膜。

除了生长在25 ℃比36 ℃好之外，其余特性均类似其他的肠道细菌。 25 ℃48 h菌落直径1 mm，生长在36 ℃只有针尖大小。