mcrA 有利于甲基化DNA（如基因组）的有效转化。
hsdR 有利于非甲基化DNA（如PCR扩增产物）的有效转化。
acZΔM15 用于蓝白斑筛选。
endA1 无Endonuclease I 酶活性，有利于质粒的纯化。
recA1 减少克隆DNA的非特异性重组。
DeoR 可以高效吸收大片段DNA，有利于文库的构建。
DE3 编码T7 RNA聚合酶，用于诱导T7-启动的表达系统的表达。
Tn10 含有四环素抗性的转座子。
OmpT 表明大肠杆菌缺乏外膜蛋白酶。缺乏外膜蛋白酶的菌株可以降低表达的外源蛋白在细菌中被降解的程度，有利于获得完整的重组蛋白。
ArgF 由于突变细菌不能利用arginine。
F’ 一个低拷贝可移动的质粒，当被M13噬菌体侵染时，可产生单链DNA。
LacI 编码lac抑制子，用于蓝白斑筛选时需加入IPTG，才可启动表达β-gal。
dam/dcm 消除了内源腺苷和鸟苷的甲基化。在此种细菌中繁殖的DNA不被甲基化
PLys 含编码T7溶菌酶的质粒；通过抑制T7 RNA聚合酶基础表达水平来降低T7启动的表达体系的基础表达水平。
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