检测质量保证 
定期使用有证标准物质和次级标准物质（参考物质）进行内部质量控制。
实验室间的比对或能力验证
利用相同或不同方法进行重复检测
对留存的样品进行在检测。
  微生物检验质控方法 （一）
菌落计数精密度控制直接计数
选择同一标本，要求检验人员进行菌落计数。
将大肠菌（25922）或经检定标化的菌片，通过合适的梯度稀释，选择合适的稀释度进行菌落计数实验操作。36±1℃培养24h进行菌落计数。
  微生物检验质控方法（二）
菌落计数精密度控制重复计数法
选择十个平板，每个平板具有合适的菌落数（100以内）。将平板编号，由实验人员进行计数并记录结果。去掉平板编号，将平板置冰箱保存过夜，次日取出，重新给予编号，由实验人员重复计数并记录。计算每位实验人员每对结果的平均数（X）。X=（a+b）/2；相对误差（rd）计算：rd=|a+b|/X×100%。其它实验人员间的相对误差范围计算：先计算所有实验人员的平均菌落数，X=[Σx]/n，要求每一结果均应在X±18.2%范围内。
  重复计数要求
自身同一平皿重复计数误差      小于7.7%
实验人员之间同一平皿重复计数误差 ±18 .2%
自身同一梯度平行加样两皿间相对误 小于7.7%
实验人员之间同一梯度计数误差X±18 .2%范围
不同梯度间菌落计数最终误差   小于7.7%
  菌种鉴定质控
菌种鉴定质控要求，对所给的微生物菌种，按有关的方法及指标进行生化、血清等方面的鉴定。
鉴定质量评价：鉴定程序是否正确；鉴定方法是否正确；具体操作技术是否熟练，结果报告是否正确。每一项设立分值为25分。总分为100分。
  内部质量控制的推荐频率
菌落计数精密度控制：    1次/3月；
菌种鉴定控制：                1次/半年或1年
盲样测定丢失的对照        1次/半年